新疆的棉花和内地棉花的首要差异首要在于优质棉花所占的份额不相同。棉花质量是按等第确认的。同等级棉花新疆棉与内地棉质量相同。

  判别棉花等第长度首要是1.色泽；2.加工质量 ；3、长度，等。等第分为1级-7级，其间一级质量为最好。

  新疆棉区原棉质量优秀，以色泽好，等第高，纤维长，经济产值高著称。1984年新疆收买陆地棉均匀等第为1.87级，其间一级棉占57.73%，纤维均匀长度27.94毫米。而同年全国均匀等第为3.58级，一级棉仅占2.98%，纤维均匀长度27.37毫米。1990年新疆陆地棉均匀等第到达1.37级,纤维均匀长度为29.70毫米。1993年，均匀等第1.9级，其间129、229约占77%。2000年1、2级棉花占80%以上。新疆有如此高质量的棉花，内地很难与之比较。

  新疆棉花栽培培育面积大，产值高，光照时间长，适合栽培棉花。高等第棉花份额大。

  2016 年，新疆的棉花栽培培育面积为 180.52 万公顷，占全国棉花栽培培育面积的53.47%；新疆棉花产值为 359.40 万吨，占全国棉花总产值的67.27%。

  据初步统计，2017年我国棉花面积同比增加300万亩，增幅6%，总产580万吨，增幅9%，单产水平进一步进步，特别是新疆产区增幅较大，进一步稳固了在我国棉花出产鹤立鸡群的位置。

  新疆长时间遵循归纳防治病虫害的技术措施,棉田生态条件较好,有利生物栽培数量多,有利于保益控害。

  新疆的光热资源丰富，日差较大，特别适合于棉花出产，加之，棉区气候枯燥，冬天酷寒，最冷气温多在-20度以下，晦气病虫越冬繁殖。

  新疆至今未发现棉花红铃虫、金刚钻、棉铃虫等产生也较少、较轻，基本上无铃病，有利于进步棉花产值和质量，削减植保防治费用。

  所以新疆的棉花栽培相对内地来说有着无与伦比的优势，天然造就了质量上的差异。